直到万历十九年（1591年），李如松坚定的倒向皇权后，才借故任他离去。

万历二十年（1592年）宁夏镇原副总兵哱拜父子与蒙古河套部落勾结发动叛乱。

连克中卫、广武、玉泉营、灵州等城，“全陕震动”。

同月，礼部给事中李献可等人在“国本”问题上向万历皇帝进言。

因言辞激烈，万历皇帝将李献可降职外调，其余人皆夺俸半年以示训诫。

然而御批下到内阁，为营救李献可，首辅王家屏拒不执行，将御批封还。

这两件事有没有必然联系不好说，但也确实有些巧合。

哱拜，原是蒙古鞑靼部的一个小酋长，因与部落酋长英台吉有矛盾，父兄皆被杀后，率领部众投奔宁夏官军。

因作战勇敢，屡建战功，渐渐由把总升至守备、游击、参将，并授宁夏卫世袭都指挥使。

他的官职远没有李成梁高，但他在宁夏的实际地位，与李成梁在辽东的地位无异。

就在造反的前一年，御史周弘和巡按宁夏边务时，还以将才推荐哱拜的儿子哱承恩、土文秀、哱云。

可见哱拜在朝中的助力不少。

实际上哱拜的提拔也离不开一个人，张居正。

哱拜造反后，宁夏的副总兵李昫奉总督魏学曾檄，摄总兵事进剿，但叛军恃河套蒙古支持，势力甚强。

此后，朝廷又调大将副总兵麻贵驰援，麻贵率苍头军在攻城同时，阻击河套蒙古援兵，斩获甚多。

然而朝廷得到的消息是所派平叛军进展迟缓。

四月，李如松经梅国桢举荐，得到了宁夏总兵的任命。

梅国桢，万历十一年（1583年）进士，历任顺天府固安知县、河南道御史、浙江道御史、太仆少卿、都察院右佥都御史。

从此人的履历来看，应是万历皇帝自己安排的人。

六月，李如松到达宁夏，同时任浙江道御史的梅国桢为监军，两人一同率领辽东、宣、大、山西兵及浙兵、苗兵等对哱拜势力进行围剿。

从这两个人的组合出征，就可以看出，万历皇帝对这场叛乱并非没有准备。

假设哱拜之乱的背后，有江南仕林的教唆的话，那么这场战争实际上就是万历皇帝向其宣战的标志。

而也就在同年的三月，赵志皋接替王家屏任首辅。

这一事件则标志着万历皇帝自己培植的文臣势力也终于登上了大明文臣之首。